根据不同的生物研究和防疫要求，生物安全柜可分为一级、二级和三级三大类，其中一类生物安全柜可保护工作人员和环境而不保护样品；二类生物安全柜也是如今应用最广泛的柜型，除了具有一类产品的作用之外，还能够保证试验品不受外界空气的污染，所有的二级生物安全柜都可提供工作人员、环境和产品的保护。
三级生物安全柜是为4级实验室生物安全等级而设计的，是目前世界上最高安全防护等级的安全柜。柜体完全气密，100%全排放式，所有气体不参与循环，工作人员通过连接在柜体的手套进行操作，俗称手套箱(Golve box)，试验品通过双门的传递箱进出安全柜以确保不受污染，适用于高风险的生物试验。
生物安全柜的标准很严格，不过目前国内还没有统一的国家标准，现有的标准都是采用欧盟标准、美国标准及各个生产厂家的标准等等，所以在安装时喝之后一段时间，国家都会对每一台生物安全柜进行性能检测。
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